通風柜的排風系統可分為集中式和分散式兩種。集中式是把一層 樓面或幾層樓面的的通風柜組成一個系統，或者整個實驗樓分成一二個系統。它的特點是通風機少，設備投資省，而且對通風柜的數量稍有增減，以及位置的變更，都具有一定的適應性。然而由于系統較大，風量不易平衡，盡管每個通風柜上都裝有調節閥，但使用不方便，并且也不容易達到預定的效果。如果系統風管損壞需要檢修時，那么整個系統的通風柜就無法使用。所以，原來采用集中式系統的實驗室，先后都改為用分散式系統。
分散式是把一個通風柜或同房間的幾個通風柜組成一個排風系統。 他的特點是：可根據通風柜的工作需要來啟閉通風機，相互不受干擾，容易達到預定的效果，而且比集中式節省能源，因為集中式系統，只要一個通風柜在使用，就得開動大通風機。分散式由于系統小，排風量也小，阻力也小，所以通風機的風量、風壓都不大，躁聲與振動相應也較小。分散式還有一個特點，是對排出不同性質的有害氣體易于處理。缺點是通風機的數量多、系統多，如果通風機集中于通風機房內，那么投資就會增大，如果通風機分散布置，而且就地安裝，雖然通風機的投資增加，但風管的投資可節省，最后總投資不一定增大。建議使用分散式。
在劃分系統時，同一個房間內如有兩個以上的通風柜，應劃為一個系統，避免-一個通風柜在使用，其他的通風柜產生倒流，使室內受到污染。同樣，一個房間內除了一個排風系統外，不宜再裝置其他排風設備。
排風系統的通風機，一般都裝在屋頂上，或頂層的通風機房內，這樣可不占用使用面積，而且使室內的排風管道處于負壓狀態，以免有害物質由于管道的腐蝕或損壞，以及由于管道不嚴密而滲入室內，此外，通風機安裝在屋頂上或頂層的通風機房內，檢修方便，易于消聲或減振。
排風系統有害物質排放高度應按現行的《工業企業設計衛生標準》和《工業三廢排放標準》執行。在一般情況下，如果附近五十米以內沒有較高建筑物時，排放高度應超過建筑物最高處兩米以上。
通風柜的風速和風機的選用
對一般通風柜可通過關閉柜門窗口大小或調整臺面屏蔽物的位置來減少開啟表面積，以達到較高的抽氣速度。建議對一般無毒的有害物通風柜操作口處設計風速采用0.25~0.38m/s，對有毒及有危害物質采用0.4~0.5m/s，對極毒物及有少量放射性有害物質采用0.5~0.6m/s。
通風機的選用
風量的計算按下列公式計算：
L=FV
式中L—排風量，m3/s：
F—通風柜操作口面積按全部打開計算
V—操作口風速m/s
風壓的確定：先計算系統阻力，再乘以1.1左右的余量，以克服使用過程中產生的不利因素。
選型：根據通風量風壓確定通風機的型號，再根據排出氣體的性質，分別選用塑料通風機、普通通風機及防爆風機，并且應盡量考慮躁聲低、震動小等因素。
風機：風機一般為離心式風機和軸流式風機兩種，分析實驗室主要用于實驗室通風柜排氣罩以及其他方面的通風和換氣。
(1) 離心式風機離心式風機型號繁多，在分析實驗室常用此類風機，風機又分為Hq≤0.98Kpa，中壓0.98KPa≤Hq≤2.94Kpa，高壓Hq> 2.94 Kpa，在選用風機時，應關注其性能和特點，要求具有以下特點：
1、風量大效率高；
2、運轉平穩，躁聲低；
3、結構完整，便于維護：
4、拆裝方便。
實驗室常用于腐蝕氣體和毒氣的通風排放，因此選擇風機時應考慮風機的材質。塑料風機和玻璃鋼風機是現代實驗室常用的風機機型。玻璃鋼風機具有耐腐蝕、耐高溫、防日曬雨淋等特點。
(2)軸流式風機軸流式風機也有低壓Hq<490Pa、高壓Hq≥490 Pa，該風機的特點是結構簡單緊湊，躁聲較小，在規定轉速下，風量風壓穩定，運轉平穩，使用安全可靠，易于安裝，該型風機由風輪、風殼、集風器三部分組成，風機為直接傳動。葉輪由葉片、輪盤和彀組成；機殼由風簡、底座及支板組成，輪彀直接裝在電動機軸上。
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