在潔凈廠房的設計和運行過程中經常出現新風設計，系統水路和風管的保溫，潔凈室壓差控制，過濾器選用等設計問題，針對以上常見情況提出幾項改善和設計注意事項。
在新風的設計中容易出現新風口風速高，新風量設計不足等問題，實際工程中，經常看到空調、通風系統的新風進風口百葉變形，甚至垮掉，主要是因為新風口設計風速太高，新風口一般采用固定防雨百葉，它的有效進風面積比較小，只有30%左右，進風口阻力較大，進風口風速比較高。這樣會導致進風口噪聲大，進風口百葉被吹垮。新風口的進風風速一般設計不宜超過3m/s， 新風口風速與新風管風速不同，新風管風速可以設計到6m/s或者更高一點，所以新風口在設計的時候要適當考慮放大進風面積。
要控制空調通風系統的新風口風速，首先要確定空調通風系統的最大新風量。如果潔凈區有熏蒸消毒的要求，如十萬級、萬級潔凈區，需要考慮消毒排風時，空調系統為直流風，這時的新風量最大，為空調系統的送風量，同時也要考慮空調系統在過渡季節加大新風量的要求。
潔凈區凈化空調系統新風量一般都能滿足操作人員對新風量的要求。但是，制劑車間外包間，燈檢間舒適性空調系統需要注意，因為外包間，燈檢間一般人員比較多，也很密集，需要的新風量比較大，制劑車間內沒有開啟的外窗，無法通過開窗補充新風，只能從空調系統中補充新風，一旦空調系統中新風量不足，就會引起室內CO2升高，操作人員感到悶氣。在設計過程中如果按每個獨立房間的新風量相加，計算空調系統的新風比，這樣進入外包間和燈檢間的新風量就會達不到要求；如果把外包間和燈檢間的新風比作為空調系統的新風比，那么新風量就高了，達不到節能的效果。
新風管、新風進風口規格按過渡季節最大新風量來考慮。要考慮過渡季節最大新風量的時候，室內風能排出去，新風也要經過適當的過濾，一般采用初效過濾器。
制藥廠的凈化空調系統中，一般排風量大，新風比高，有條件可以考慮利用熱回收設備進行新風和排風的能量交換，回收排風中的能量。
使用熱量回收裝置的時候需要注意幾點：1、盡量采用全熱回收裝置，特別是凈化空調系統，要盡量采用全熱回收裝置，全熱回收與顯熱回收相比，能量回收利用率比較高；2、不論采用轉輪熱回收裝置還是板式熱回收裝置，都要考慮對進入熱回收裝置的新風和排風進行過濾，最好能達到中效過濾，因為換熱器被灰塵污染，引起熱交換效率降低；3、排風和新風口盡可能有一定高差或拉開一段距離，防止新排風短路。
空調系統風管、水管保溫有3個方面的作用。為了減少能量損失，為了減少風管、水管內流體溫度的變化，為了防止結露。空調系統水管和風管保溫時需要注意兩項。1、保溫結構不能留有空隙。比如送風管保溫，風管支架吊架與風管之間要有墊層，不能產生冷橋，風管法蘭要保溫。風管軟接頭要采用有保溫層的軟接頭，空氣冷凝水管、冷凍水管也一樣，保溫層不能留有空白，否則沒有做到保溫的地方就會產生結露滴水；2、保溫層或者保溫層外面的保護層要嚴密，不能讓空氣滲進，一旦保溫層有縫隙，空氣就會滲入保溫層，在管壁上結露，久而久之保溫層含水增高，水作為一種導熱性能良好的導體，提供了保溫層的導熱系數，使保溫層失去保溫性能。
控制潔凈室的壓差是為了控制潔凈室之間氣流滲透的方向，避免較潔凈的潔凈室被相鄰潔凈室的氣流污染，是潔凈室內潔凈度控制的重要手段。
潔凈室壓差在潔凈室空調系統運行過程中，隨著送回風量的變化也是在不斷變化的，維持潔凈室內穩定的壓差有幾種方法，1、在室內回風口設計成可調風量的風口。室內壓差變化了，直接調整回風口風量，校正壓差；2、在排風支管調節閥處裝壓差微調裝置，根據室內壓差變化自動調節排風閥開度，控制室內排風量，保證室內壓差；3、在潔凈室送風管和排風管上裝自動定風量調節閥，維持室內送排風量恒定，維持壓差恒定。
初效、中效過濾器的選用主要考慮過濾器的額定風量，過濾器的終阻力一般按初阻力的兩倍計算，高效過濾器選用須按小于等于額定風量選擇，過濾器的過濾風量小于額定風量，過濾效率高，阻力小。對凈化空調系統來說，空調器的新風處理最好采用初效和中效兩級過濾，這樣對空調機組后面的中高效，高效過濾器具有一定的保護作用，最主要的是對空調機組的加熱器，表冷器盤管也是一種保護，因為盤管的翅片間距較小，特別是表冷盤管，一旦被灰塵污染，很難清洗，影響傳熱效率。
潔凈室的高效過濾器不能采用木框過濾器，避免產生霉菌。對于同一個凈化空調系統，各個房間的送風高效過濾器效率要一致，阻力相近。這樣就可以做到各個過濾器的容塵量比例一致，運行過程中阻力上升一致，風量分配均勻。
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