與PCR實驗室建設相關的指導文件主要有四份：
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《醫療機構管理條例》
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《醫療機構臨床實驗室管理辦法》
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《臨床基因擴增檢驗實驗室管理暫行辦法》
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《醫療機構臨床基因擴增實驗室管理辦法》
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臨床PCR實驗室，不但在實驗室設置及儀器設備等硬件上要滿足開展臨床檢驗的條件，而且要求實驗室在日常工作要有文件化的工作程序。
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下面就在PCR實驗室建設過程中的幾個關鍵控制點進行闡述:
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01 PCR實驗室質量管理體系
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根據實驗室的具體情況編寫質量體系文件，《質量手冊》、《程序文件》、《作業指導書》，并保證管理體系運行有效。
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管理體系的特點是應有明確的目的、規范的管理、有效的制約、高效的機制、能自我發展的整體。
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建立完善的SOP文件，對完成各項質量活動的方法作出規定，每個SOP都應對一個或一組相互關系的活動進行描述。
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每個SOP文件應說明該項質量各環節的輸入、轉換和輸出所需的文件、物資、人員、記錄以及它們與有關活動的接口關系。
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明確每個環節轉換過程中各項因素的要求，即由誰做、做什么、做到什么程序、達到什么要求，如何控制、形成什么記錄和報告，以及相應的審批手續。
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規定在質量活動中需要注意的例外或特殊情況的糾正措施。SOP應簡練、明確和易懂并且工作人員熟練掌握和嚴格遵守。
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02 PCR實驗室的相關設置
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要完成一組PCR實驗，通常需要經過試劑配制、樣品處理、核酸擴增和產物分析4個實驗過程。
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這4個實驗過程的實驗用房應相鄰布置，組成一個獨立的PCR實驗區。標準的PCR實驗區包括:試劑準備區、標本制備區、擴增區、產物分析區、各區配套的緩沖區及公共走廊。
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PCR實驗室整體平面布局
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某醫院PCR實驗室平面布局如圖1所示，整個區域有一個公用走廊，每個獨立實驗區設有專門的緩沖區。通過壓差控制，使整個PCR實驗過程中試劑和標本免受氣溶膠的污染，并且降低擴增產物對人員和環境的污染。
圖表1、某醫院PCR實驗室平面圖
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1.試劑準備區
該實驗區主要進行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應混合液的制備。
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試劑和用于標本制作的材料應直接運送至該區，不得經過其他區域。試劑原材料必須貯存在本區內，并在本區內制備成所需的貯存試劑。
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試劑準備區配備有2~8°C冰箱和-80°C冰箱，計算冷負荷時，需要將它們計算在內。
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房間的面積宜控制在15m2~20m2。本區的壓力梯度要求為:相對正壓狀態，以防止外界含核酸氣溶膠的空氣進入，造成污染。
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2.標本制備區
該區域主要進行的操作為臨床標本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定RNA時cDNA的合成。
標本制備區配備有2~8°C冰箱和-20°C冰箱，計算冷負荷時，需要將它們計算在內。在標本制備區，還需要配備生物安全柜，用于進行提取核酸的操作。
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為避免提取的核酸在柜內反復循環，造成標本之間的交叉污染，出現假陽性結果，該區域配備的生物安全柜必須是B2型的。生物安全柜工作區垂直氣流全部來自實驗室，排風經過高效過濾器過濾后直接排至室外，不允許回到安全柜和實驗室中。
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根據經驗，如果實驗室內配備生物安全柜，每配備一臺，實驗室的面積增加10m2;標本制備區的面積宜在25m2~30m2之間。本區的壓力梯度要求為:相對于鄰近區域為正壓，以避免從鄰近區進入本區的氣溶膠污染。
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3.擴增室
該區域主要進行的操作為DNA或cDNA擴增。此外，已制備的DNA模板和合成的cDNA(來自樣本制備區)的加入和主反應混合液(來自試劑貯存和制備區)制備成反應混合液等也可在本區內進行。
在巢式PCR測定中，通常在第一輪擴增后必須打開反應管，因此巢式擴增有較高的污染危險性，第二次加樣必須在本區內進行。
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擴增室主要配備PCR實驗室的核心儀器PCR儀。
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在實驗室建造過程中，需要給PCR儀配備專門的UPS電源，以保證其正常工作。該區面積控制在15m2~20m2。
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本區的壓力梯度要求為:相對于鄰近區域為負壓，以避免氣溶膠從本區漏出。為避免氣溶膠所致的污染，應盡量減少在本區內的不必要的走動。個別操作如加樣等應在超凈臺內進行。建議采用5~10Pa壓差，在控制上比較容易實現。
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4.產物分析區
該區域主要進行的操作為擴增片段的測定。如使用全自動封閉分析儀器檢測，此區域可不設。
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在室內配備通風櫥，保證房間內的相對負壓，空氣從室外流向室內。該區面積控制在15m2~20m2。
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本區是最主要的擴增產物污染來源，因此對本區的壓力梯度的要求為:相對于鄰近區域為負壓，以避免擴增產物從本區擴散至其它區域。建議采用5~10Pa壓差，在控制上比較容易實現。
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03 正負壓區域緩沖室的設置
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根據壓力梯度的要求，試劑配制室和樣品處理室為相對正壓，擴增室和產物分析室為相對負壓，要求正壓的區域和要求負壓的區域的緩沖室內的壓力設計大不相同。
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正壓緩沖室符合一般正壓潔凈室的緩沖原則，主要是防止室外環境空氣中的氣溶膠進入室內。
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負壓緩沖室則是要求緩沖室對核酸擴增室及產物分析區保持正壓，對緩沖室外也保持正壓(主要是滿足室內凈化需要，如室內無潔凈要求，此處可以為0壓)。
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04污染的預防與控制
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PCR實驗室設計的核心問題是如何避免污染。在實際工作中，常見的有以下幾種污染類型:擴增產物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標本間的污染。因此要避免污染，首先應是預防，而不是排除。
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·??? 工作區域的嚴格劃分，各個實驗區域要有明顯的標記(如醒目的門牌或不同的地面顏色等)，以避免各個不同實驗區域設備物品、試劑等發生混淆。
·??? 合理的系統設置，合理的空調通風系統設置，盡量采用全送全排的空調系統;嚴格的氣流壓力控制，保證不同的實驗區內不同的壓力要求。
·??? 規范的操作，臨床基因擴增檢驗實驗室的技術人員必須進行上崗培訓，在實驗操作過程中，操作者必須戴手套，并經常更換。清潔工作及時、正確。實驗工作結束后，必須立即對本區進行清潔。
·??? 嚴格的管理:嚴格控制進出實驗室的人員。在各個實驗區域使用帶有明顯區別標志的工作服(如不同顏色)，當工作人員離開時不得將本區的工作服帶至其它區域;盡量減少在實驗區內不必要的走動以減少交叉污染的可能性。擴增產物分析區是最主要的擴增產物污染來源，廢液不能在實驗室中傾倒，必須經消毒液浸泡消毒后在遠離實驗室的地方棄掉，用過的吸頭等一次性材料也應經消毒液浸泡消毒后統一處理，如焚燒等;
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新冠病毒核酸檢測的實驗室要求
1.核酸檢測過程包括標本處理、核酸提取，進行PCR檢測等多個步驟，平均檢測時間需要2-3個小時。由于它是直接對我們采集標本中的病毒核酸進行檢測，特異性強，敏感度相對較高，是當前主要的檢測手段。
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2.《關于做好防范疫情輸入相關城市新型冠狀病毒檢測工作的通知》聯防聯控機制綜發〔2020〕128號文件中要求：加強實驗室檢測質量控制，開展檢測的實驗室應當使用經藥監部門批準的檢測試劑和采樣拭子。疾控機構實驗室開展PCR檢測應當具備相應條件。醫療機構實驗室開展PCR檢測應當按照要求通過技術審核，在省級衛生健康行政部門登記備案。
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疾控機構和醫療機構實驗室開展新型冠狀病毒檢測，均應當納入質量控制體系，開展實驗室室內質控和室間質評工作，并符合實驗室生物安全要求。醫學檢驗實驗室開展新冠病毒相關檢測，應當符合《醫學檢驗實驗室基本標準（試行）》《醫學檢驗實驗室管理規范（試行）》等要求，保證生物安全和遺傳資源管理符合相關規定。
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3. 《新型冠狀病毒實驗室生物安全指南（第二版）》國衛辦科教函﹝2020﹞70號 、《新型冠狀病毒肺炎防控方案（第五版）附件<新型冠狀病毒肺炎實驗室檢測技術指南>》國衛辦疾控函〔2020〕156號均提出：根據目前掌握的新型冠狀病毒的生物學特點、流行病學特征、臨床資料等信息，該病原體暫按照病原微生物危害程度分類中第二類病原微生物進行管理。具體要求：感染性材料或活病毒在采用可靠的方法滅活后進行的核酸檢測、抗原檢測、血清學檢測、生化分析等操作應當在生物安全二級實驗室進行。
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4. 國家衛生健康委員會辦公廳《關于進一步加強新冠肺炎疫情防控期間發熱門診設置管理和醫療機構實驗室檢測的通知》國衛辦醫函〔2020〕263號中要求三級綜合醫院均應建立符合生物安全二級及以上標準的臨床實驗室，有條件的專科醫院、二級綜合醫院也應當完善相關配備，提高冠狀病毒核酸檢測能力。
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5.《病原微生物實驗室生物安全管理條例》2018年修改：第二十五條 新建、改建或者擴建一級、二級實驗室，應當向設區的市級人民政府衛生主管部門或者獸醫主管部門備案。
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6.《關于進一步做好疫情期間新冠病毒檢測有關工作的通知》聯防聯控機制綜發〔2020〕152號：落實實驗室備案或準入要求，依法依規檢測。
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新冠病毒檢測應當由符合條件的醫療機構（包括獨立設置的醫學檢驗實驗室）和疾控機構開展。醫療機構開展病原學檢測應當具備在設區的市級人民政府衛生健康主管部門備案的生物安全二級及以上實驗室資質，且符合《醫療機構臨床基因擴增檢驗實驗室管理辦法》（衛辦醫政發〔2010〕194號）的要求，具有PCR實驗室條件。