潔凈手術部經過竣工驗收合格后，工程由施工單位移交給建設單位。潔凈手術部的日常管理與維護，是保證潔凈手術部安全、高效運行的重要保障。
潔凈手術部工程在移交時，施工單位還要針對潔凈手術部工程整理、編制出一套《易損備件表》及《使用與維護手冊》，交于建設單位使用或維護部門，以便指導后期維護。
《使用與維護手冊》的內容如下：
建筑裝飾維護方法及注意事項；
通風空調系統維護方法及注意事項，常見故障判斷與排除方法；
電氣系統維護方法及注意事項，常見故障判斷與排除方法；
用氣體系統維護方法及注意事項，常見故障判斷與排除方法；
給排水系統維護方法及注意事項，常見故障判斷與排除方法；
潔凈手術部售后服務分施工單位承擔的服務和建設單位或使用單位自行的維護服務服務。對于施工單位承擔的服務應該按施工服務承諾書的內容進行服務，建設單位或使用單位自行的維護服務如下：
潔凈手術部日常維護工作中要掌握檢驗時機及部位如下：
1、每日通過凈化自控系統進行機組監控并記錄，發現問題及時解決；每月對非潔凈區域局部凈化送、回風口設備進行清潔狀況的檢查，發現問題及時解決。
2、每月對各級別潔凈手術部至少進行1間靜態空氣凈化效果的監測并記錄。
3、每半年對潔凈手術部進行一次塵埃粒子的監測，監控高效過濾器的使用狀況并記錄。
4、每半年對潔凈手術部的正負壓力進行監測并記錄。
5、潔凈手術部綜合性能指標測定（靜壓差、截面風速、換氣次數、自凈時間、溫濕度、新風量、潔凈度級別和細菌濃度等技術指標）醫院每年進行一次，結果符合相關規定要求，有記錄。
6、新風入口過濾網：1周左右清掃1 次，多風沙地區周期縮短；過濾器更換周期：粗低效過濾器：
7、1～2 個月；中效過濾器：2～4 個月；亞高效過濾器：1 年以上；高效過濾器：3 年以上。
8、對潔凈區域內的非阻漏式孔板、格柵、絲網等送風口，應當定期進行清潔。
9、對潔凈區域內回風口格柵應當使用豎向柵條，每天擦拭清潔1 次，對濾料層應按照上述規定更換。
10、負壓手術部每次手術結束后應當進行負壓持續運轉15分鐘后再進行清潔擦拭，達到自凈要求方可進行下一個手術。過濾致病氣溶膠的排風過濾器應當每半年更換一次。
11、熱交換器應當定期進行高壓水沖洗，并使用含消毒劑的水進行噴射消毒。
12、對空調器內部加濕器和表冷器下的水盤和水塔，應當定期清除污垢，并進行清洗、消毒。對擋水板應當定期進行清洗，對凝結水的排水點應當定期進行檢查，并進行清潔、消毒。
潔凈手術部的日常檢驗項目主要包括：外觀檢查；單機試運轉試驗；聯機試運轉試驗；換氣次數測定；靜壓差測定；高效過濾器阻力監測及檢漏。高效過濾器阻力的監測。
潔凈手術室的日常管理可以貫穿在手術前、手術中、手術后的全過程，體現在每日、每周、每月、半年、年的全周期。我們來看一張日常管理流程圖：
從以上流程圖可以看出潔凈手術部的凈化空調系統應當在手術前30分鐘開啟，手術部清潔工作應在每天手術結束后凈化空調系統運行時進行，達到自凈時間后關機。手術結束后迅速清理手術床及用物，并進行空氣消毒>30min。未經清潔、消毒的手術間不得連續使用；按不同級別關閉手術間，達到自凈時間，進行下一臺手術。術中被手術病人血液或體液污染的物面和地面，應用及時用醇類或含氯消毒液進行擦拭，消毒液的濃度根據感染類型進行選擇。清潔的順序應遵循從相對清潔到污染的原則，避免污染擴散。另外，手術部用物必須保持整齊、清潔，物面無塵，地面無碎屑、無污跡。定期清洗與保養。還有每日保潔：當天手術結束后進行徹底清潔消毒，包括壁柜、無影燈、儀器、器械車、手術床、操作臺面、地面。在無明顯污染情況下，物體表面用清水擦拭，內外走廓、輔助間地面每天濕式拖抹二次（上午第一場手術開始后和當天手術結束后各一次）。再到每周保潔：室內外環境衛生徹底清潔，包括天花板、窗戶、墻壁、空調機濾網等每周清潔擦拭一次。